成分不同、颜色不同。
1、成分不同：玛瑙的主要成分是二氧化硅，而金丝玉的主要成分是硅酸盐矿物质。
2、颜色不同：玛瑙的颜色多样，有红色、褐色、**、绿色和黑色等，而金丝玉的颜色主要以**、金**和棕**为主。
玛瑙是一种条带状结构的隐晶质石英岩玉，主要见于火山喷出岩和凝灰岩的气孔和裂隙之中，颜色丰富多样。金丝玉特指产于新疆准格尔盆地及其周围地区的石英岩玉，多为**、红色，内部可见萝卜纹。水晶是一种无色透明的二氧化硅结晶，呈六棱柱状。
玛瑙、金丝玉、水晶的区别玛瑙是一种有着条带状结构的隐晶质石英岩玉，主要见于火山喷出岩和凝灰岩的气孔和裂隙之中。由于二氧化硅胶体在冷凝的过程中会混入许多岩石中的致色离子，所以玛瑙的颜色非常丰富，包括红色、白色、绿色、黑色等，外表非常好看。
金丝玉特指产于新疆准格尔盆地及其周围地区的石英岩玉，是近几年才兴起的一种石英岩玉。当火山热液沿着地层裂隙充填冷凝形成金丝玉矿床后，经风化剥蚀、流水搬运，最终达到新疆克拉玛依地区的古河床。金丝玉颜色多为**、红色，表面可有裂纹，内部可见萝卜纹。
水晶是一种无色透明的二氧化硅结晶。由于只有在二氧化硅结晶完美时才会形成水晶，所以水晶是一种贵重矿石。完美的水晶常呈六棱柱状，柱体为一头尖或两头尖，形态多样。当水晶中含有微量元素时还会出现粉色、紫色、**等颜色。
